O Ubuntu é mais sensível a possíveis falhas de disco, e irá informá-lo muito antes do Windows. Observe as mensagens que o Ubuntu está lhe dando. Sua unidade está falhando. Eu não me importo com o que o Windows (especialmente o XP) diz. No momento em que o Windows descobrir, você provavelmente nem conseguirá inicializar a unidade.
Sim, unidades novas em folha podem falhar. Eu tive exatamente a mesma coisa que aconteceu com o meu disco Western Digital 1TB (era um defeito de fábrica com essa linha de drives). Desde que é novo, você pode obtê-lo substituído sob garantia do fabricante. Faça isso o mais rápido possível.