Não, o arquivo ainda é /etc/fstab
no Ubuntu 12.04.1. Eu instalei e usei. Observe também que você não pode inicializar o Ubuntu sem esse arquivo.
Acho que o caso é que a nova instalação do Ubuntu 12.04.1 criou um novo arquivo /etc/fstab
e, portanto, suas entradas para inicializar as unidades do Windows foram perdidas.
Sugiro que você adicione essas entradas novamente ao seu arquivo /etc/fstab
para montá-las novamente.