Bem, as compilações do AFAIK estão programadas em paralelo, isso depende apenas de onde você está na fila (normalmente, o backup de x86_64 é mais do que o i386). Se você deseja criar um pacote Architecture-All somente para x64, você pode simplesmente modificar o arquivo debian/control , alterando todas as instâncias de Architecture: all para Architecture: amd64 ; Dessa forma, nenhuma compilação i386 ocorrerá.
Se você realmente precisa de algo construído agora , você também pode alterar o urgency no changelog para avançar na fila, mas é preciso estar atento ao uso indevido se isso for puramente pessoal. tipo PPA build :) IMO Eu simplesmente dpkg-buildpackage se isso fosse uma coisa única.