Você precisa redirecionar a saída de stderror stream para stdout stream, pois as exceções são registradas em stderr stream. O snippet abaixo pode filtrar o strace de exceção e imprimir até 10 linhas a seguir.
$ java -jar /bin/MyApp.jar 2>&1 | grep "^Exception" -A10
Nota:
Você pode usar o comando jps para localizar o processo java para a Sun JVM. Você também pode tentar os comandos pidof ou pgrep ou grep '[j]ava' (este também não listará seu processo (grep)).