Gravar corretamente um arquivo .iso em um disco não coloca um arquivo .iso no disco. Esses arquivos são cópias bit-a-bit do conteúdo de um disco, incluindo a estrutura do sistema de arquivos. Então, o que você verá são os arquivos contidos na imagem .iso, em vez do próprio .iso. Isso é semelhante a extrair um arquivo .zip (ou outro arquivo) para uma pasta.
Para criar a unidade USB ao vivo, use o arquivo .iso que você gravou no CD. Se você baixou este arquivo no Windows e está atualmente trabalhando com o Ubuntu Live CD, então você precisará encontrar a partição do Windows no navegador de arquivos (ele deve aparecer no lado esquerdo da janela do navegador de arquivos) e nessa unidade , navegue até Users/[your username]/Downloads
(para Windows Vista / 7) ou Documents and Settings/[your username]/Downloads
(para Windows XP) e você deverá encontrar o .iso lá.