Resposta curta é que o Linux é um sistema operacional multiusuário e sua conta é apenas um dos usuários. Você, como um único ser humano, pode ter várias contas, mas cada uma delas é separada, incluindo raiz, que é um superusuário (mas você não quer nunca usar essa conta, exceto temporariamente para manutenção do sistema). Você é apenas o proprietário do seu diretório pessoal.
Uma das deficiências dos sistemas Windows anteriores era que ele assumia principalmente um único usuário, e esse usuário único geralmente era o administrador. Era possível não funcionar como administrador, mas era muito inconveniente e muitas coisas simplesmente não funcionavam; não havia uma maneira fácil de se tornar temporariamente administrador. Mas os administradores tinham autoridade para instalar vírus e outros malwares. Se você pode executar o Windows a partir de um nível de privilégio de usuário "normal", como no Linux, você provavelmente ficaria muito pouco na forma de malware.
O Linux oferece a capacidade de executar temporariamente um programa ou executar uma operação como root. Às vezes isso é necessário, mas deve ser usado o mínimo possível. Antigamente, o administrador fazia logon como root, realizava algumas tarefas administrativas e, em seguida, fazia logoff da conta raiz. Mas isso teve problemas, em que o administrador pode ficar com preguiça e simplesmente fazer logon como root, ou esquecer de fazer logoff e causar danos, para que os sistemas modernos tenham uma maneira mais temporária para usuários normais obterem privilégios de root elevados. . Mesmo que pareça mais um problema, ele se torna uma segunda natureza e ajuda a protegê-lo de erros inadvertidos, fazendo com que você pense mais sobre o fato de estar fazendo algo possivelmente destrutivo ao usá-lo.
Quando você instala ou executa programas como raiz, esses programas podem, por sua vez, acessar diretórios que são de propriedade de raiz, como / etc, para arquivos de configuração. Se você não instalá-los como root, eles não podem fazer isso
Alguns diretórios são de propriedade de root, mas possuem privilégios configurados de tal forma que qualquer um pode gravar nele, como / tmp. Se você olhar as permissões de / tmp, verá que todos têm permissão para ler e gravar nele, embora somente root e determinados membros do grupo possam excluir um arquivo que eles não possuem ou possuem permissão de gravação para (o "t" em vez de x para todos os usuários).