Adicione a rc.local, acima de exit 0
SCHEDULER=$(cat /sys/block/sda/queue/scheduler)
case "$SCHEDULER" in
*deadline* )
echo 'deadline' > /sys/block/sda/queue/scheduler
echo '1' > /sys/block/sda/queue/iosched/fifo_batch
;;
*noop*)
echo 'noop' > /sys/block/sda/queue/scheduler
;;
*)
exit 0
esac
Execute o script com o sudo, ou se for um script de inicialização, ele será executado como root.
Veja também o link