Até agora, a única maneira que vi para não montar dispositivos externos é:
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Abra o terminal e digite:
gconf-editor
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Desça até Nautilus - > Preferências - > Mídia Automount
- Desmarque a opção Media Automount
Testei após desmarcar a opção Media Automount sem reiniciar o sistema e ele não montou automaticamente o meu iPod, mas ele ainda estava listado em Lugares - > iPod e disponível para montagem, que é igual a sucesso.
Depois, desmontei o iPod, reiniciei o sistema e liguei o meu iPod ao sistema. Mais uma vez, ele não montou automaticamente e também estava novamente em Lugares - > iPod e disponível para ser montado.
Eu não sei se é apenas um acaso ou um bug que você tem, mas usar o gconf-editor funcionou para mim, então eu sugiro que você dê outro tiro?