Bem-vindo. Normalmente, no Ubuntu, você não lida diretamente com o diretório /usr/bin
ao instalar um novo programa. Se você vem do mundo do Windows, geralmente não extrai o programa para Arquivos de Programas e começa a usá-lo. Você executa o assistente de instalação para fazer a instalação para você.
O mesmo aqui. Você pode instalar um programa pesquisando-o no Centro de Software e clicando no botão de instalação.
Em casos como o seu, onde o software foi baixado de um site, você geralmente baixa um arquivo .deb que pode ser instalado abrindo um terminal e executando sudo dpkg -i <filename>.deb
.
Certifique-se de ter baixado o pacote do Ubuntu e da arquitetura correta (32 bits / 64 bits).