Mesmo quando esta questão parece estar relacionada ao áudio, você está se referindo a um AVI, que é de fato um arquivo de vídeo.
No entanto, a transcodificação pode ser feita por vários aplicativos que possuem interface gráfica e de comando.
Eu prefiro, é claro, aqueles que possuem uma interface gráfica, dos quais posso mencionar: Mobile Media Converter (somente para sistemas de 32 bits), Transmaggedon, SoundConverter e muitos outros.
SoundConverter (SoundKonverter também no KDE) permitirá que você extraia o áudio de uma fonte de vídeo.
Websites oficiais:
Ao transcodificar, você pode escolher vários parâmetros como: formato de áudio e vídeo, bitrate de áudio e vídeo e mais algumas opções (pelo menos nas opções avançadas do Mobile Media Converter)