Acontece que existe um arquivo .desktop para lxrandr que você pode editar com o conteúdo de um arquivo ARandR.
por exemplo. aqui está o meu arquivo ARandR para um laptop com um monitor externo conectado.
$ cat ~/.screenlayout/dual.sh
#!/bin/sh
xrandr --output VGA-0 --mode 1920x1080 --pos 0x0 --rotate normal --output LVDS --mode 1280x800 --pos 1920x280 --rotate normal --output HDMI-0 --off
e aqui está o lxrandr com o comando xrandr adicionado e o comando antigo comentado:
$ cat ~/.config/autostart/lxrandr-autostart.desktop
[Desktop Entry]
Type=Application
Name=LXRandR autostart
Comment=Start xrandr with settings done in LXRandR
Exec=xrandr --output VGA-0 --mode 1920x1080 --pos 0x0 --rotate normal --output LVDS --mode 1280x800 --pos 1920x280 --rotate normal --output HDMI-0 --off
#Exec=xrandr --output LVDS --mode 1280x800 --rate 59.8 --output VGA-0 --mode 1920x1080
OnlyShowIn=LXDE