Existe uma interface de linha de comando oficial do Dropbox CLI) que pode ajudá-lo.
Para desvincular sua conta do Dropbox, você pode seguir estes instruções (sem vincular sua conta depois). Basicamente, basta parar o Dropbox e mover / renomear sua pasta do Dropbox ( ~/.dropbox ) para uma pasta de backup ( ~/.dropbox.old ) que pode ser removida se não for mais necessária.