Afaik, todos os ambientes de desktop no Ubuntu, juntamente com muitos aplicativos, têm dependências rígidas da presença de módulos de software Bluetooth. No entanto, eu não acho que haja uma razão para se preocupar por causa de sua presença, já que você pode desativá-los trivialmente em Control Center → Bluetooth 1 :
Não tenho adaptador Bluetooth, por isso não consigo ativar nem desativá-lo, mas você ainda pode ver o controle na captura de tela.
1 Isso está no Centro de Controle do GNOME. O Unity Control Center parece um pouco diferente, mas também possui uma seção de Bluetooth.