JMH como você mesmo descobriu:
pip3 instala o pacote
instala o pacote para o intérprete python3
e
pip instala o pacote
instala o pacote para o intérprete python2
Até o momento, não há maneira de instalar simultaneamente para ambos os intérpretes usando um único comando. Portanto, use pip e pip3 de acordo.
Além disso, é imprudente alterar os aliases do python . Para invocar o interpretador python3, use o comando python3 e, para o python2, use o comando python.
Codificação feliz!