Eu tinha o incrível tema Adapta instalado no meu sistema. Então eu corri este script para instalar mais temas. Não tenho certeza de qual foi a mudança, mas desde então o tema do Adapta está dando à barra lateral do Nautilus e ao menu de contexto uma aparência como essa:
Considerando que ele deve ter espaçamento normal como este: 
E aqui está o menu de contexto: 
Eu tentei instalar o Adapta do último master da fonte, de um ponto no passado eu sabia que funcionava, mas simplesmente não funciona. Tenho certeza que não é um bug com o código do Adapta como alguns outros temas também começaram a mostrar esse comportamento.
O que deu errado com o meu sistema e como posso corrigi-lo e fazer com que os temas funcionem corretamente no meu sistema?
Informação do sistema: GNOME 3.18 no Ubuntu 16.04
De acordo com a descrição do o script que você vinculou , ele instala os temas no diretório ~/.themes . Portanto, remover esse diretório deve desfazer a ação do script mencionado anteriormente.
Depois de remover o diretório ~/.themes , remova o tema Adapta do seu sistema.
Em seguida, reinstale-o em seu PPA executando
sudo add-apt-repository ppa:tista/adapta
sudo apt-get update
sudo apt-get install adapta-gtk-theme