Você precisa abrir o Chromium, acessar as configurações avançadas, encontrar as configurações Notificações , encontrar o site para o qual essas notificações são válidas e desativar as notificações. Você também pode desativar totalmente as notificações para sites da Web no Chromium.
Há também uma configuração avançada para manter o Chromium em execução em segundo plano para alguns "apps", o que provavelmente mantém o processo em execução e essas notificações.