A "resposta" à sua pergunta é: A mensagem "getfattr: [nome do arquivo]: Operação não suportada" é porque o squashfs não suporta ACL.
e link
% bl0ck_qu0te%Portanto, como o squashfs não suporta ACL ou "atributos estendidos", você está recebendo a mensagem "getfattr: [nome do arquivo]: Operação não suportada", os arquivos em seu squashfs não possuem atributos estendidos, ponto final. O nunca será, não importa qual versão do squashf você use.
Veja o link
% bl0ck_qu0te%Para não receber essa mensagem, não use a ACL.
Essa mensagem não tem nada a ver com a versão do kernel na versão do squashfs-tools como você está perguntando em "eu acho que este erro porque a versão do kernel não é igual a squashfs-tools"
Não sei ao certo como isso afeta sua iso personalizada, ele ainda deve ser inicializado bem, já que a ACL não é obrigatória para inicializar ou executar o Ubuntu, e a maioria das pessoas não os utiliza.
Se você está tendo um problema com sua iso personalizada, é necessário fornecer detalhes de como você a fez.
Qual foi sua base .iso? Que personalização você fez? e melhor, qual comando você usou para fazer os squashfs e iso?
Além de explicar a causa da mensagem, é impossível fornecer mais apoio devido à falta de informações que você postou, apesar da discussão extensa.