Você precisa primeiro reduzir os volumes lógicos do LVM e somente então você pode diminuir o volume físico do LVM.
Para isso você precisa pelo menos do KDE Partition Manager 3.0.x (disponível no Kububtu 17.04 ou em vários outros Live CDs). Nenhuma versão do gparted pode redimensionar volumes lógicos do LVM.
P.S. O espaço livre de 12 MiB é exatamente o espaço não ocupado pelos volumes lógicos do LVM, não é o espaço livre dentro das partições lógicas do LVM.