Versão resumida: não.
Geralmente, você precisa fazer uma instalação limpa com um novo / home para evitar que as sobras da versão mais nova quebrem a versão mais antiga.
Dito isso, eu consegui restaurar o backup de uma instalação do Kubuntu 14.04 depois que uma atualização para o 16.04 não funcionou totalmente, e não tive grandes problemas com as coisas que o 16.04 tinha alterado no meu / home - mas isso não é algo em que você pode contar . Uma instalação limpa é a maneira mais confiável de ter uma instalação totalmente funcional quando você está pronto.