Isso parece um bug sutil para mim, que parece ocorrer aleatoriamente no meu caso. Para contornar isso, redimensionar a janela a partir da borda inferior corrige o problema.
Coloque o cursor na parte inferior da janela do aplicativo para alterá-lo para o modo de redimensionamento; e depois basta arrastar o mouse para a borda inferior da tela. Isso tornaria a barra de título visível novamente.
A captura de tela é ao usar o Ubuntu GNOME, mas é assim que o cursor também pareceria no caso do Unity.