A maioria dos programas Linux são escritos em C ( Aqui está porque), embora o Python provavelmente esteja ganhando muita popularidade nos dias de hoje.
Dito isto, não há linguagem exclusiva para o Ubuntu. O que eu posso pensar é o que mais se aproxima, é o Bash. Você pode escrever scripts no Bash para determinados trabalhos. Vala também deve contar, mas é para desenvolvedores Gnome em geral.