Você pode criar uma regra do udev para desativar o bluetooth interno
sudo -H gedit /etc/udev/rules.d/81-bluetooth-hci.rules
Cole o seguinte em
SUBSYSTEM=="usb", ATTRS{idVendor}=="105b", ATTRS{idProduct}=="e065", ATTR{authorized}="0"
Salvar, sair do editor de texto e reinicializar