Eu tive o mesmo problema há alguns dias. O que eu fiz para resolver esse problema foi bem simples. Basta editar o arquivo / usr / share / unattended-upgrades / unattended-upgrade-shutdown na linha 120 desta maneira:
Antes: se apt_pkg.config.find_b ("Unattended-Upgrade :: InstallOnShutdown", False)
Depois: se apt_pkg.config.find_b ("Unattended-Upgrade :: InstallOnShutdown", falso)
Espero que também funcione para você.