O touchpad do meu laptop se comportou de maneira estranha, então decidi desativar a aceleração (sem saber o que é exatamente), usando este guia . Os problemas com o cursor do meu mouse foram resolvidos e, por causa disso, tive a oportunidade de notar a aceleração do ponteiro (porque ele não estava desativado por esse script)
Eu iniciei o boot dual do meu windows, e notei que o mouse se comporta exatamente da mesma maneira que no Ubuntu 16.10.
Isso me faz concluir que ou eu alterei as configurações do mouse no nível do hardware com esse ajuste ou atinhei o comportamento do mouse padrão (insuspeitado).
Para testar isso, eu gostaria de saber se os ajustes são aplicados em cada inicialização, ou se eles são de alguma forma aplicados para sempre, e transferindo o arquivo 50-mouse-acceleration.conf para fora de sua pasta ou comentando o código, não seria o suficiente para reverter as configurações como elas costumavam ser.
Alterar um arquivo de configuração como esse não ajusta o mouse em um nível de hardware. Sendo um Arquivo de Configuração X, ele será lido toda vez que o servidor X iniciar, definindo as configurações de aceleração do mouse. Se você desligou no seu sistema Ubuntu, e seu sistema Windows está se comportando da mesma forma, então pode-se concluir com segurança que o Windows, por padrão, não está usando aceleração de mouse, ou que ele está muito próximo de como foi definido seu sistema Ubuntu.