A mensagem significa que você precisa estar atualmente localizado em sua pasta pessoal e, em seguida, executar o script de instalação para iniciar o processo de instalação.
Para fazer isso, basta abrir o terminal e executar o script de instalação a partir dele, usando o caminho completo para o script de instalação.
./path/to/installscript
que pode ser
./home/<your username>/Downloads/R2016b_glnxa64_dvd1/install