É um pouco incerto o que você está perguntando, mas independentemente se você quer acabar com o linux ou windows ou qualquer outra coisa, você normalmente quer executar o instalador para o sistema operacional de sua escolha e selecionar "substituir a unidade inteira". "com o novo sistema operacional. Isso normalmente irá reparticionar e formatar tudo para que você comece do zero, não é nada técnico. Se você quiser terminar com o linux, execute a instalação do Linux a partir da mídia (DVD ou USB ou etc) e selecione a opção como essa. Para janelas, mesma história.
Se você está tentando adicionar sua unidade como uma unidade separada em um sistema operacional existente, ela pode ser configurada para ser o dispositivo de inicialização principal, de modo que você acabe inicializando nela. Você disse que já tentou inicializar a partir da mídia de DVD, mas como outra pessoa já disse, se a mídia for ruim, passaria para a próxima opção. Provavelmente, você pode pressionar F8 ou F12 ou algo parecido na tela do POST para selecionar o dispositivo de inicialização preferido. Você precisará ler a documentação do BIOS ou examinar atentamente a tela POST quando o computador começar a exibir o conteúdo após a reinicialização. POST é a primeira tela do computador (Power On Self Test) se você não soubesse. Você pode normalmente pressionar DEL ou F2 para entrar no BIOS e em alguma outra tecla, como F8 ou F12, para entrar em um menu de seleção de inicialização. Eu acho que nem todos os sistemas BIOS suportam isso.