Use as Configurações do sistema - > Aparência seção para selecionar um dos temas padrão que vem com o Ubuntu (Adwaita ou Ambiance por exemplo). Se você não puder selecionar um tema por causa do espaço ausente e da interface do usuário, tente usar uma ferramenta como gnome-tweak-tool
.
Quando você atualizou para 16.10 o tema que você estava usando pode não ser compatível e o sistema não retornou automaticamente para um tema que funciona.
Eu tive o mesmo problema que você descreveu e isso resolveu para mim.