Não tenho ideia do problema, mas você já tentou outras ferramentas de gravação?
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O
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K3d é excelente e muito rico em recursos em geral. A quantidade de recursos pode tornar um pouco mais difícil de usar embora. Para um trabalho simples como esse, você pode facilmente ignorá-los.
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Você sempre pode usar
dd if=/dev/cdrom of=/tmp/backup.iso bs=8M
e um gravador de CD de linha de comando. Mais em Como faço para gravar um ISO de DVD usando o terminal? ou Gravando um CD ou DVD usando as ferramentas Command Line .Se eles falharem com um erro semelhante, considerarei uma falha de firmware ou hardware.