A execução de unity --reset corrige este problema.
Por nenhuma razão óbvia eu perdi as decorações para janelas maximizadas (feche, minimize, redimensione botões) e a possibilidade de mudar janelas ao clicar no symol do aplicativo no starter (uma nova instância é iniciada o tempo todo).
No compizconfig-settings-manager ( ccsm ) posso reativar as decorações, mas o plug-in de decorações de janelas incompatível com o plug-in unit e com ele usando unity não faz muito sentido. Não há outro cenário que tenha saltado nos meus olhos em ambos os plugins que poderiam trazer as decorações de volta. Eu não posso simplesmente experimentá-los porque eu já experimentei as configurações padrão em ccsm para serem incompatíveis umas com as outras, de modo que as mudanças consequentemente exijam a redefinição de unity .
Estou usando o Ubuntu 16.04