Na tela de login, você ainda está configurado para fazer login no XFWM. Na sua tela de login, você pode alterar o que você deseja fazer login (XFWM ou openbox) e ele vai se lembrar da configuração após as reinicializações.
O método que você está usando agora é uma mudança única para o openbox, e é por isso que, quando você reinicializa, você volta para o XFWM.
Diferentes distros usam diferentes gerentes de exibição (a tela de login), e cada um tem uma opção em algum lugar para selecionar em qual gerenciador de janelas você deseja entrar. Não estou familiarizado com o Xubuntu mais recente, mas o que você está procurando é uma opção de "Sessão" ou um menu suspenso ou um pequeno ícone de engrenagem. Esses são os 3 tipos usuais.