Se você está perguntando se você adiciona uma regra de iptable como root, isso afeta outros usuários, então YES. Iptables são coisa do kernel, então é o nível mais baixo de regras. Por exemplo, se você estiver usando firewall como o CSF e banir / dropar / negar ip específico, o programa (CSF) apenas traduzirá seu ban para uma regra do iptables e o kernel começará a soltar pacotes daquele IP.