A melhor maneira de fazer isso é mover todos os dados do drive do Ubuntu para drives montados. Como seus documentos, imagens, downloads, conteúdo de desktop, etc. A maneira mais fácil seria então limpar sua instalação de 32 bits e instalar a versão de 64 bits.
Certifique-se de verificar onde aplicativos como o Thunderbird, o Firefox etc. armazenam o backup e os levam para um local seguro também.