O PulseAudio-Equalizer é o melhor para o ambiente de desktop Unity e Gnome. Ele possui um Equalizador Gráfico de 15 bandas com muitos presets disponíveis e está completamente integrado com o Indicador de Áudio na bandeja do sistema do Ubuntu 15.10 Wily Werewolf e também com o VLC media player e o Popcorn Time.
Para instalar, basta seguir as etapas abaixo:
sudo add-apt-repository ppa:nilarimogard/webupd8
sudo apt-get update
sudo apt-get install pulseaudio-equalizer