Eu recomendaria usar o ISO "minimal" ou "netinstall", que baixará e instalará apenas um sistema principal, além dos pacotes que você selecionar. Se bem me lembro, não inclui algumas das coisas mais "server" que o Ubuntu Server inclui. Como ele faz o download de pacotes on-the-fly, não haverá um monte de atualizações para instalar uma vez que você inicialize em seu novo sistema.