Ao usar a opção de disco para disco do Clonezilla, primeiro será solicitada uma unidade de origem e, em seguida, a unidade de destino. A unidade de destino será sobrescrita e todas as informações nela serão perdidas.
Isso contrasta com a outra opção, disco a imagem, na qual você primeiro é solicitado a selecionar um dispositivo de destino no qual a imagem será salva. Então, no final, você será perguntado qual unidade (ou unidades) você deseja incluir.
Espero que isso venha ajudar.