O Ubuntu ajusta o clock automaticamente conforme o requisito. Se algum de seu processo precisar de um clock maior para funcionar de maneira ideal, ele será alcançado. Você pode monitorar o desempenho usando a chamada de ferramenta Psensor.
O procedimento de instalação é assim:
sudo apt-get install lm-sensors hddtemp
sudo sensors-detect
sudo service kmod start
sudo apt-get install psensor