FYI, o Ubuntu Software Center está obsoleto e será em breve será removido do Ubuntu . Atualmente, o Ubuntu está trabalhando na integração do Centro de Software GNOME no Ubuntu, e estará desenvolvendo um método para integrar seu sistema de pacotes de aplicativos instantâneos no Centro de Software GNOME.
No que diz respeito a submissões de aplicativos baseados em elétrons, eu não acho que deveria haver um grande problema se, no final, fosse apenas um arquivo deb ou um pacote mal-humorado. Ao mesmo tempo, posso estar errado e seria melhor pedir uma fonte mais credível sobre isso. Eu sugiro falar com alguns desenvolvedores que implantaram e mantêm pacotes no Ubuntu Software Center. Além disso, você também pode simplesmente oferecer um PPA ou um arquivo deb para download em um site ou do Github (como, por exemplo, o Github faz para seu editor de texto Atom, que é outro aplicativo baseado em Electron).