O kernel do Fedora provavelmente não funcionará bem com o Ubuntu, já que os kernels não estão em sincronia entre as distros e cada distro aplicou patches específicos de distro, como apparmor no Ubuntu e Selinux no Fedora.
Provavelmente, é melhor compilar um kernel personalizado a partir dos repositórios do ubuntu usando os patches do Ubuntu.
Melhor, qual problema você está tendo com o kernel ubuntu?