A maneira recomendada / mais fácil é inicializar o Ubuntu (Studio) do USB ao vivo e simplesmente deixar o instalador automático (instalar o Ubuntu 16.04 e deixar o instalador fazer o particionamento para você) ou, quando ele perguntar como você deseja partição, clique em "Algo mais" e use o particionador manual do instalador que aparece. Naturalmente, eu esperaria que você soubesse o que está fazendo se aceitar essa opção!
Eu acho que você também pode tentar rodar os discos do GNOME do Live USB se você quiser tentar. E você pode instalar o Gparted no USB ao vivo para rodar isso ( aparentemente você precisa selecionar 'armazenado em espaço reservado' ao criar o Live USB via Startup Disk Creator para fazer isso ) ou você pode usar Gparted Live para particionar o SSD de antemão, mas isso é mais complexo.
Realmente, basta usar o instalador. Eu não posso dar qualquer descida adequada em prós e contras (você precisará esperar por alguém para responder se você quiser), mas eu posso dizer que usar o instalador para particionar é recomendado e provavelmente mais fácil.
Se você tiver problemas sérios (com isso quero dizer um problema adequado, não "não gosto de como o instalador faz isso") com o particionamento com o instalador, tente reproduzir o problema executando o instalador depois de clicar 'Experimente o Ubuntu' (em vez de 'Instalar o Ubuntu) no início e executando o comando ubuntu-bug ubiquity no Terminal, de preferência depois de reproduzir o bug (verifique se você está conectado à Internet). Então os desenvolvedores podem tentar corrigir o bug.