Da minha experiência, geralmente é uma má idéia fazer o flash supersu em uma instalação CM13, porque o supersu já é suportado pelo CM13 (nas opções do desenvolvedor, o item "acesso root"), e há alguns problemas conhecidos em fazer assim. Aqui estão algumas coisas que eu tentaria:
Primeiro, verifique se a depuração USB está ativada para o adb. Você pode ativá-lo em Configurações > opções de desenvolvedor > Depuração Android. Você também pode tentar habilitar o acesso root para o ADB. Inicialize na recuperação e experimente "dispositivos adb". Se isso não funcionar, você pode tentar as seguintes etapas:
1- Se você puder detectar seu dispositivo no modo fastboot (dispositivos fastboot), exiba uma nova recuperação (TWRP ou clockworkmod).
2- Reinicie no fastboot
3- Vá em recuperação
4- Tente dispositivos adb. Se funcionar, formate sistema, dados, cache e reinstale tudo (exceto supersu; p).
Se isso não funcionar, sugiro que você exiba a imagem de fábrica da Motorola no modo fastboot e tente as etapas de 1 a 4 novamente.
Se tudo falhar, sugiro consultar a página associada da sua ROM no XDA.