Você poderia começar com o kernel atual que você tem em sua instalação atual do Ubuntu. Eles são armazenados em / boot, por exemplo:
ls /boot/config*
/boot/config-4.2.0-18-generic /boot/config-4.3.0-1-generic
/boot/config-4.2.0-19-generic /boot/config-4.3.0-2-generic
e copie o diretório relevante que você quer para o diretório de código fonte do Linux:
cp /boot/config-4.2.0-19-generic .config
você pode editar manualmente o arquivo .config ou usar a ferramenta de configuração de menu, por exemplo
make menuconfig