Primeiro, você não precisa fazer isso. Se você quiser iniciar o MATLAB no menu Unity, não precisará alterar essas permissões e provavelmente não deverá.
Tudo o que você precisa fazer é executar sudo apt-get install matlab-support no Terminal ( Ctrl + Alt + T ). Isso deve fazer com que você possa acessar o MATLAB através do iniciador Unity. Você pode ter que sair e voltar novamente para fazer com que todas as alterações tenham efeito.
Em seguida, se você não quiser ter que executar o MATLAB como root a cada vez, convém executar cd ~ && sudo chown YOURUSERNAME -R ~/.matlab/ .
No entanto, você só quer iniciá-lo indo para essa pasta e clicando duas vezes no executável, execute estes comandos:
sudo chmod +rwx /usr/local/MATLAB/MATLAB_Production_Server/R2015a/bin/matlab
sudo chown YOURUSERNAME -R /usr/local/MATLAB/MATLAB_Production_Server/R2015a/