Você pode editar manualmente o arquivo /etc/apache2/sites-enabled/000-default.conf (suponho que você tenha uma configuração do Apache estritamente padrão no seu servidor).
Você então muda a linha
#ServerName www.example.com
e coloque em qualquer endereço IP que você usa para se conectar de seus clientes, provavelmente o endereço IP do servidor em eth0:
ServerName 192.168.0.100
Se você tiver um serviço de DNS local, também poderá usar o nome do seu servidor, como:
ServerName www.localserver.local
Nesse caso, os clientes e também o servidor precisarão resolver esse nome.
Uma vez que isso é gravado no arquivo, reinicie o serviço Apache (ou reinicie o computador) e a mensagem irritante deve ir embora para sempre.
HTH