Depende do que você quer. Deixei o net eng game há alguns anos, mas usei o Quagga para os meus laboratórios e servidores de rotas.
Eu adorei como a configuração era muito parecida com uma configuração da Cisco, e tinha um suporte v6 praticamente completo que eu gostava muito na época. Ele também tem (tinha?) Suporte ISIS.
Tudo se resume ao que você precisa. Ouvi dizer que o pássaro está muito focado no BGP, mas o Quagga definitivamente não é desleixo nessa área também.
Aqui está um tópico da lista NANOG de 2010 que eu participei com algumas informações sobre o dilema Pássaro x Quagga, e outro tópico do mesmo grupo datado de apenas um casal de anos atrás.