A instalação do pacote via apt-get e dpkg normalmente não toca em suas preferências específicas do usuário (configurações) e documentos. Os programas que seguem a especificação do Diretório base do XDG normalmente terão suas configurações armazenadas no ~/.config/ pasta. Alguns criam subdiretórios (como ~/.config/vlc/ ), outros armazenam um arquivo diretamente no diretório (como ~/.config/Texmakerrc ).
Outras configurações são normalmente encontradas nos chamados dot-files , que são arquivos e diretórios ocultos armazenados no seu diretório pessoal (como ~/.mozilla/ ).
As configurações do KDE 4 geralmente podem ser encontradas abaixo de ~/.kde/share/config/ ou ~/.kde/share/appps/ . Outro local para procurar configurações é ~/.local/share/ .
Como uma dica geral, para encontrar as configurações que foram alteradas recentemente, use o programa find com a opção -mmin -X para procurar arquivos que foram alterados nos últimos X minutos. Por exemplo, encontre todos os arquivos ( -type f ) no seu diretório pessoal ( ~ ) que mudou nos últimos dez minutos ( -mmin 10 ) e imprima informações detalhadas ( -ls ):
find ~ -type f -mmin -10 -ls