Ainda não existe uma versão estável do Ubuntu com o kernel 4.x.
Existem módulos l2tp nos kernels atuais do Ubuntu por um longo tempo.
Parece que você entendeu mal algo sobre l2tp. Você precisará de um aplicativo de espaço do usuário (xl2tpd ou openl2tpd) para usar o protocolo l2tp.
Esses aplicativos usam módulos do kernel. Agora estou escrevendo isso conectado com l2tp para ISP.