Consegui corrigi-lo um pouco por tentativa e erro. Acabei de entrar na configuração de exibição nas configurações do sistema e escolhi a resolução de tela correta e a taxa de atualização para o terceiro monitor e desta vez funcionou.
Eu deletei monitors.xml
de /home/user/.config/monitors.xml
Esta foi uma solução muito óbvia e uma que tenho certeza que tentei antes, então eu estaria interessado se alguém pudesse oferecer uma explicação ou solução mais adequada.