Eu encontrei uma boa linha rSync na maior parte usando vários posts de toda a rede para chegar a um bom formato de cópia. Isto é o que acabei usando:
sudo rsync -av --exclude=/dev/* --exclude=/lost+found/* --exclude=/mnt/* --exclude=/home/ --exclude=/media/* --exclude=/bakroot/ --exclude=/proc/* --exclude=/sys/* --exclude=/tmp/* --exclude=/var/run/* --exclude=/var/lock/* --exclude=/var/cache/apt/archives/* / /bakroot/
Excluímos /home
porque já tenho esse backup em outra partição em outro lugar.
Em seguida, para restaurar, basta desligar as unidades e reinstalar o grub usando estes comandos:
1. Boot with any live CD
2. Get a root shell and make a folder (mkdir ubuntu)
3. mount the root (/) partition of ubuntu (e.g. mount /dev/hdb ubuntu if you have two disks)
4. chroot the mounted partition (chroot ubuntu)
5. grub-install /dev/hda [1]
5. Exit the shell
6. Reboot
Então, durante o tempo, isso parece funcionar.