Este comando não atualiza seus aplicativos. Apenas atualiza a lista de pacotes ("lista de aplicativos"). Use isto para atualizar seus aplicativos:
sudo apt-get update && sudo apt-get upgrade
Para resolver seu problema real, vá para Configurações do Sistema → Acesso Universal e verifique se "Texto Grande" está desativado (deve ser o padrão).
Em seguida, execute este comando:
sudo apt-get install unity-tweak-tool
Quando terminar, abra a ferramenta de emenda da unidade e clique em "fontes". Escolha tamanhos de texto menores.