Coloque as seguintes linhas no seu arquivo ~/.bashrc
.
<path/to/java>
será algo como /usr/java/jdk1.5.0_07/bin/java
dependendo de qual versão você instalou.
Você também pode definir o java padrão para usar executando o comando abaixo e selecionando as opções desejadas na lista:
% bl0ck_qu0te%